前言:
现时兄弟们对“ubuntu安装gfortran”大体比较看重,同学们都想要分析一些“ubuntu安装gfortran”的相关内容。那么小编同时在网上收集了一些有关“ubuntu安装gfortran””的相关内容,希望小伙伴们能喜欢,我们快快来了解一下吧!1.首先安装Ubuntu20.04 amd64,安装过程比较简单,在此不做叙述了。下面出场的就是硬件们了~~~龙芯3C5000来了我也搭!目前只能用下E5 2682 V4了,主频也是2.5G,不过集成了16个核心,支持HT~
2.链接网络,更新系统:
①执行更新
# apt-get update
②安装ssh工具和net工具,方便远程操作及熟悉的ifconfig指令
#apt-get install ssh
# apt-get install net-tools
③安装samba,建立同Windows之间的文件传递
#apt-get install samba samba-common
安装完成后配置samba,步骤如下:
a.新建Ubuntu端共享文件夹
# mkdir –p /home/share
b.修改samba配置文件
# vi /etc/samba/smb.conf
c.在配置文件最后添加:
[node01]
comment = node01 share
path = /home/share #此处为Ubuntu端需要共享的文件夹绝对路径
browseable = yes
writable = yes
available = yes
valid users = node01 #此处为登陆samba的用户,必须在Ubuntu中存在
d.修改共享文件夹权限使得Windows访问后可以读写,#chmod 777 /home/share
e.设置samba访问用户密码,为了方便可以直接设置用户登陆密码:
# smbpasswd -a node01
需要输入2次,输完按一次回车。
root@node01:/home/node01# smbpasswd -a node01
New SMB password:
Retype new SMB password:
Added user node01.
f.重新启动samba服务,# service smbd restart
g.回到Windows端,运行输入:\\192.168.199.200,可以看到文件夹node01,双击输入用户名密码(即之前e步骤所指)
h.然后就可以方便的交互文件了,这是笔者最喜欢的方式,当然是同一网络网段内方便,比ftp好玩。
接下来就是给系统减负,不启动桌面直接进命令行模式。
a.# vi /etc/default/grub
将:GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="quiet splash"
改为:GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="text"
b.# update-grub
c.# systemctl set-default multi-user.target
d.# reboot
至此可以安心开始HPL测试环境的搭建了:
Ⅰ.安装gcc、gfortran、make等必要工具
# apt-get install gcc
# apt-get install g++
# apt-get install gfortran
# apt-get install make
Ⅱ.将hpl-2.3.tar.gz、mpich-3.3.2.tar.gz和OpenBLAS-0.3.17.tar.gz拷贝到samba共享文件夹(本文为/home/share/HPL文件夹下):
a.解压mpich-3.3.2.tar.gz并进入源码文件夹
# tar zxvf mpich-3.3.2.tar.gz
# cd mpich-3.3.2
配置mpich和安装:
# ./configure --prefix=/usr/local/mpich3.3.2
# make
# make install
设置环境变量脚本
# cd /home/share/HPL
# touch env.sh
# vi env.sh
添加如下内容:
export PATH=$PATH:/usr/local/mpich3.3.2/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/mpich3.3.2/lib
# chmod 777 env.sh
b.解压OpenBLAS-0.3.17.tar.gz并进入源码文件夹
# tar zxvf OpenBLAS-0.3.17.tar.gz
# cd OpenBLAS-0.3.17
# make
# make PREFIX=/usr/local/openblas install
c. 解压hpl-2.3.tar.gz并进入源码文件夹
# tar zxvf hpl-2.3.tar.gz
# cd hpl-2.3
接下来配置Makefile文件,在setup文件夹下有很多模板,此处使用Make.Linux_PII_FBLAS
# cp setup/Make.Linux_PII_FBLAS .
# mv Make.Linux_PII_FBLAS Make.E5x2
上门的E5x2就是这个Make的体系结构名称,后续需要用到,因为我的主板是双路E5,名称随意取即可
修改:
ARCH = E5x2
TOPdir = /home/share/HPL/hpl-2.3
MPdir = /usr/local/mpich3.3.2
MPlib = $(MPdir)/lib/libmpi.so
LAlib = $(LAdir)/lib/libopenblas.a
CC = /usr/local/mpich3.3.2/bin/mpicc
CCFLAGS = $(HPL_DEFS) -pthread -fomit-frame-pointer -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops -W -Wall
LINKER = /usr/local/mpich3.3.2/bin/mpif77
保存后关闭,开始编译
# make arch=E5x2
完成后会在顶层目录下生成bin文件夹
# cd /home/share/HPL/hpl-2.3/bin/E5x2
里面有2个文件,分别是:HPL.dat和xhpl,前一个是配置测试用的参数,通常调参数就是指的改它内容。接下来测试运行:
# mpirun -np 4 ./xhpl
其中4表示使用4个进程运行,建议和cpu的物理核心数量一致(注意区分是否开启了HT,满载测试HT会减低效率)
另外推荐一个HPL建议网站:
多节点MPICH-HPL测试
上面讲述了单节点的配置和运行测试,一般使用环境都是多节点并行集群计算形式,因此多节点测试十分必要,也很有意思。
a.首先需要配置ssh无密码互访,建立节点间的网络传递
# ssh-keygen -t rsa
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa): Created directory '/root/.ssh'.
Enter passphrase (empty for no passphrase):
Enter same passphrase again:
Your identification has been saved in /root/.ssh/id_rsa
Your public key has been saved in /root/.ssh/id_rsa.pub
The key fingerprint is:
SHA256:nszzwk6rQGp6How2xkbK8mYwZUpoM6eYqNVNg8tWA9w root@node01
The key's randomart image is:
+---[RSA 3072]----+
| . . |
| o E |
|. o |
|.=o.. = |
|=*=o.= oS |
|%+.o= .+ . |
|=@=.. .B |
|*+=. . .o+ |
|.=o .oo.. |
+----[SHA256]-----+
然后分别在3台机器上运行该命令生产公钥
# cd ~/.ssh
# touch authorized_keys
在三台机器上分别添加另外2台机器信息
# vi /etc/hosts
笔者设置的内容如下:
root@node01:~/.ssh# cat /etc/hosts
127.0.0.1 localhost
#127.0.1.1 node01 #需要注释掉
192.168.199.204 node03
192.168.199.203 node02
192.168.199.205 node01
# The following lines are desirable for IPv6 capable hosts
::1 ip6-localhost ip6-loopback
fe00::0 ip6-localnet
ff00::0 ip6-mcastprefix
ff02::1 ip6-allnodes
ff02::2 ip6-allrouters
测试node01同node02、node03连通性(其余同理),正常机器会把名称替换为IP,ping通即可
# ping node02
# ping node03
在node01-node03上运行
# cat id_rsa.pub >> authorized_keys
最偷懒的方法就是通过putty复制各自的公钥到所有节点:
node02→node01
node03→node01
最后将node01的公钥(包含node01 node02 node03的公钥)完整复制到其他2台节点上。
然后第一次ssh nodeXX需要输入yes,往后就不用密码直接、互相ssh登录任意node了。
b.然后开始通过ssh复制需要运行的hpl测试程序到所有node
首先在node02和node03上面建立相同的文件夹(本文是在node01上面编译安装mpich、openblas和hpl的)
# mkdir -p /home/share/HPL
# chmod 777 /home/share/HPL (权限设置,否则scp拷贝容易失败)
拷贝hpl到node02(node03同理,IP、文件夹路径根据实际情况修改)
# scp -r hpl-2.3 node02:/home/share/HPL
同理,mpich和openblas编译好的拷贝至/usr/local
# scp -r /usr/local/openblas node02:/usr/local
# scp -r /usr/local/mpich3.3.2 node02:/usr/local
c.建立mpich环境脚本
export PATH=$PATH:/usr/local/mpich3.3.2/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/mpich3.3.2/lib
保存为:env.sh,同样拷贝到每个节点,然后在个节点# source env.sh一下即可,各节点就可以使用mpirun、mpicc等工具了。
d.建立并行主机核心分配文件
node01:32
node02:32
node03:32
保存为:servers,下一步给mpirun –f使用,表示每个节点node提供32个计算核心,当然可以每个4核心,看实际情况,本文用了2路E5 2682 V4因此每个节点共计32个核心,每个节点共计32GB DDR4 ECC内存,3节点一共96核心。共计128GB内存!够用了够用了。[憨笑]
接下来就可以正式运行测试!
# mpirun -np 96 -f /home/share/HPL/servers ./xhpl
然后就进入漫长的计算了~~~通过修改HPL.dat文件参数提升成绩。3个节点96个核心都在100%负荷运行了~~~
标签: #ubuntu安装gfortran #ubuntu怎么建立c文件 #ubuntu 204安装教程 #ubuntu安装mpich详细教程