前言:
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在数据科学和机器学习领域,因果推断是一个重要的课题。旨在从数据中识别变量之间的因果关系,比如说:“如果我做了某件事,会发生什么?”这类问题,而非仅是描述“某件事与其他事情有关联”。
Dowhy 作为一个用于因果推断的Python工具包,提供了一种简单而强大的方法来进行因果推断分析。
介绍
Dowhy 是一个由微软发布的端到端的用于 因果推断(Causal Inference)的 Python 库。
旨在简化从数据中识别因果关系的过程。Dowhy 提供了一整套统一标准的API,支持从建模到识别,再到因果效应估计和验证的整个工作流程。
主要特点:基于一定经验假设的基础上,将问题转化为因果图,验证假设。提供因果推断的接口,整合了两种因果框架。DoWhy支持对后门、前门和工具的平均因果效应的估计,自动验证结果的准确性、鲁棒性较高。Dowhy 的整个因果推断过程可以划分为四大步骤:「建模」(model):利用假设(先验知识)对因果推断问题建模。「识别」(identify):在假设(模型)下识别因果效应的表达式(因果估计量)。「估计」(estimate):使用统计方法对表达式进行估计。「反驳」(refute):使用各种鲁棒性检查来验证估计的正确性。安装及API使用
接下来,为大家介绍下Dowhy库的安装和基本用法。
包括如何加载数据、定义因果模型、进行因果推断分析等。
安装
Dowhy的安装同其他Python三方库一样,直接使用pip命令安装即可。
pip install dowhy
如果存在依赖,需额外安装pygraphviz库
API使用步骤:
1、导入所需的库, 并加载数据(这里以加载csv文件为例)
# 导入所需的库import pandas as pdimport dowhyfrom dowhy import CausalModel# 加载数据data = dowhy.datasets.linear_dataset( beta=10, # 因果效应值 num_common_causes=5, # 混杂因子,用w表示,作用于干预变量和结果变量 num_instruments=2, # 工具变量,用 Z 表示,作用于干预变量(间接影响结果) num_samples=10000, # 样本数量 treatment_is_binary=True) # 干预为二元变量,用 v 表示df = data["df"] # DoWhy 使用 pandas 的 dataframe 来载入数据print(df.head(5))
输出数据:
Z0 Z1 W0 W1 W2 W3 W4 v0 y0 0.0 0.478130 0.313025 0.274645 1.794765 -1.551661 1.250724 True 17.0339791 0.0 0.546833 -0.197845 -2.404349 1.120160 -1.011344 0.812087 True 3.0747402 0.0 0.874135 1.047078 -0.056460 0.440413 -0.067349 0.970203 True 15.5300703 0.0 0.913483 0.934282 -1.180582 0.498135 -1.079074 -1.659924 True 5.0468094 0.0 0.366969 -0.364818 0.630643 -0.330043 0.572139 -0.433893 True 11.004590
2、执行因果推断,建模,生成因果关系图
model=CausalModel( data = df, treatment=data["treatment_name"], outcome=data["outcome_name"], graph=data["gml_graph"] )model.view_model() # 对构建的因果图可视化from IPython.display import Image, displaydisplay(Image(filename="causal_model.png"))
利用这张图来识别因果效应(从因果估计量到概率表达式)并进行估计。
3、识别和估计因果关系
识别
可以脱离于数据,仅根据图进行识别,其给出的结果是一个用于计算的「表达式」。
identified_estimand = model.identify_effect()print(identified_estimand)
输出结果:
Estimand type: EstimandType.NONPARAMETRIC_ATE### Estimand : 1Estimand name: backdoorEstimand expression: d ─────(E[y|W1,W0,W4,W2,W3])d[v₀] Estimand assumption 1, Unconfoundedness: If U→{v0} and U→y then P(y|v0,W1,W0,W4,W2,W3,U) = P(y|v0,W1,W0,W4,W2,W3)### Estimand : 2Estimand name: ivEstimand expression: ⎡ -1⎤ ⎢ d ⎛ d ⎞ ⎥E⎢─────────(y)⋅⎜─────────([v₀])⎟ ⎥ ⎣d[Z₁ Z₀] ⎝d[Z₁ Z₀] ⎠ ⎦Estimand assumption 1, As-if-random: If U→→y then ¬(U →→{Z1,Z0})Estimand assumption 2, Exclusion: If we remove {Z1,Z0}→{v0}, then ¬({Z1,Z0}→y)### Estimand : 3Estimand name: frontdoorNo such variable(s) found!估计
estimate = model.estimate_effect(identified_estimand, method_name="backdoor.propensity_score_stratification")print(estimate)
输出结果:
*** Causal Estimate ***## Identified estimandEstimand type: EstimandType.NONPARAMETRIC_ATE### Estimand : 1Estimand name: backdoorEstimand expression: d ─────(E[y|W1,W0,W4,W2,W3])d[v₀] Estimand assumption 1, Unconfoundedness: If U→{v0} and U→y then P(y|v0,W1,W0,W4,W2,W3,U) = P(y|v0,W1,W0,W4,W2,W3)## Realized estimandb: y~v0+W1+W0+W4+W2+W3Target units: ate## EstimateMean value: 9.942351552191596
可以通过 target_units 参数来选择因果效应分析的群体,如 ate(群体层面)、att(干预组)、ate(对照组)。也可以指定结果修改变量来分析不同变量对结果的影响。
当然因果关系也可以验证其准确性,DoWhy 中的专业术语叫反驳,通过某些类型的混杂因子或随机变量进行干预。
总结
Dowhy是一个非常强大且实用的Python库,用于进行因果推断分析。它提供了工具和方法来识别因果关系、估计因果效应,并验证因果推断的可靠性。该库的设计简单易用,旨在帮助用户进行可解释的因果推断分析。
当然 DoWhy 也有其局限性。有些情况结果可以会有偏差。虽然它提供了多种工具来测试模型稳健性,但最终结果的可信度还取决于因果模型的合理性和数据质量。
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