在决定使用 MySQL 还是 MongoDB 时，我们需要考虑一系列因素。让我们逐步进行思考：

1. 数据模型：MySQL 是一个关系型数据库，它使用表、行和列来存储数据。这种结构适用于具有明确定义的数据模型的情况，特别是当数据间存在复杂的关系时。MongoDB 是一个 NoSQL 数据库，使用文档和集合来存储数据。这种数据模型非常灵活，允许存储更多的数据类型和不同结构的数据。如果你的数据结构固定并具有复杂关系，请选择 MySQL。如果你的数据结构灵活且难以用表格表示，请选择 MongoDB。

2. 数据库查询和索引：MySQL 提供了强大的 SQL 查询功能，允许进行复杂的查询、联接和事务操作。而 MongoDB 通过其自有查询语言提供了高效的查询功能，但它不支持内置的事务处理。所以，如果你的应用程序需要进行复杂的查询和事务处理，请考虑使用 MySQL。如果查询要求不高且无需处理复杂事务，MongoDB 可能是一个更好的选择。

3. 一致性和可靠性：MySQL 支持事务处理，具有强一致性和原子性。MongoDB 默认为最终一致性，并在某些情况下可以支持事务。如果应用程序对数据一致性有严格要求，请使用 MySQL。当对可靠性和一致性要求较低时，MongoDB 可能是一个合适的选择。

4. 横向扩展和高可用性：MongoDB 的设计使其更容易进行水平扩展，通过添加副本集和分片可以实现故障转移和自动负载均衡。MySQL 的水平扩展需要更多的手动配置，例如使用分区表或在应用程序中实现数据库分片。如果横向扩展和高可用性是关键需求，则 MongoDB 可能是更好的选择。

5. 社区和生态系统：MySQL 是一个广泛使用的关系型数据库管理系统，拥有庞大的社区和丰富的生态系统。MongoDB 作为NoSQL 数据库的一员，尽管社区相对较小，但近年来越来越受欢迎。如果需要广泛的支持、丰富的文档和大量的可用工具，请选择MySQL。如果你希望尝试新兴技术并加入快速发展的社区，请选择MongoDB。

综上所述，MySQL 和 MongoDB 的选择取决于你的具体需求和项目情况。在做决策时，请认真考虑数据模型、查询需求、一致性要求、扩展性和生态系统等因素。如有可能，对于特定的应用场景，可以进行实际的系统性能和功能测试，以确定最佳的数据库选择。