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原创 小果 生信果

R语言是一个强大的数据分析工具，其强大之处在于有各种各样的R包帮助其实现各种各样的功能。

关于R包安装，你是否也遇到过一些困扰呢，比如我，对于一般的R包，可以使用install.packages(‘’)直接安装，但是碰到比一般的软件，就会出现如下惨案：

生信分析相关的部分R包可以用Bioc安装，安不了的可以尝试安装源自Github（）的R包，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github函数来进行安装。

代码如下

```install.packages('BiocManager')library(BiocManager)BiocManager:install("")```

接下来便是安装源自Github（[]()）的R包了，需要先安装devtools包，然后用devtools包里的install_github函数来进行安装。

代码如下

```install.packages('devtools')library(devtools)install_github('')```colortools和seurat可以用devtools安装：```devtools::install_github("gastonstat/colortools",force=TRUE)  devtools::install_github('satijalab/seurat-data',force=TRUE)```

```###更新代码：install.packages("rlang")```

总结一下，R包的安装主要有五种方法，包括：

1）install.packages("")直接安装；

2）从R语言官网上直接下载相关R包并安装；

3）从Bioconductor上下载R包并安装；

4）从Github上下载R包并安装；

5）手动安装R包。其中前三种都是利用代码直接自动化下载并安装，最后一种需要手动下载并安装。

如有问题，可以找小果哦。